新浪科技

中国首个国家基因库为什么建在深圳?

新浪科技

关注

文章来源:南方会微信公众号(nanfanghui shenzhen)

5年前,国家发改委批复同意深圳依托华大基因研究院组建国家基因库,这是中国第一个、全球第四个国家级基因库。再过半个月,9月22日,位于深圳市大鹏街道下沙片区“禾塘仔”地块的国家基因库将正式运营。

昨天(9月6日),小编和几位来自京沪穗的同行们提前探营,第一次走进了这个梯田形状的国家基因库。这里不仅能看山、看海,还设有咖啡厅,跟我想象中可大不一样。

先来一张航拍图看看外观:

为什么采用梯田的设计理念?这栋与周围环境融为一体的绿色建筑与外界相对独立,将基因库功能、历史文化与原有优美自然环境相融合。

国家基因库所处的深圳大鹏新区,可以说是一个“生态岛、生物岛、生命岛”,东西涌海滨、杨梅坑、大鹏半岛国家地质公园都在大鹏。深圳国际生物谷也位于大鹏,该生物谷计划打造为国际领先的生物科技创新中心、全球知名的生物产业聚集基地。

华大基因总部位于盐田区,距离国家基因库约半小时车程。(点开可看大图)

国家基因库占地面积超过5万平方米,建筑总面积11.6万平方米。其中Ⅰ期建筑面积4.75万平方米,二期还在规划中,未来还有三期。

一进大门是二楼,“国家基因库”几个大字是用木头制成,体现了基因库三生(生态、生产、生活)的设计理念。这一层设有多功能厅和展厅。据说这里未来也将承担科普教育的功能,社会团体预计可通过相关申请程序进入参观噢。

三楼摆放着华大基因自主研发的150台BGI-Seq500基因测序仪,以及一台造价2000万美元的Revolocity超级测序仪。这些价值 N个亿 的设备,每天将产生大量的数据。

四楼是机房。

五楼是样本库,还设有一个咖啡厅。

一到这层,我们首先看到的是很多台海尔冰箱,温度接近-80℃。

国家基因库执行主任、华大基因研究院院长徐讯告诉我们,国家基因库为样本提供了四种选择,分别是4℃冷库、-20℃冷库、-80℃冷库和液氮。

这次虽然没能看到液氮储存的样本,不过以前我此前在丹麦见过一次很特别的,所以也没有遗憾啦。有兴趣的朋友可以戳这里:全球最大精子库50%客户竟是单身女性。

咖啡厅充分利用自然采光,设计灵感据说来自洋葱的细胞壁。你能看出来吗?

六楼是办公区域,风景怡人。站在露台上能看到远处的大海。未来将有数百人在国家基因库工作,这样的工作环境不错噢。

参观完这个神秘的国家基因库了,我们再来了解一下它的功能吧。

国家基因库于2011年10月由国家发展改革委、财政部、工业和信息化部以及国家卫生和计划生育委员会四部委批复,并由深圳华大基因研究院组建及运营。这是中国第一个也是唯一的一个获批筹建的国家基因库,其重要性不言而喻。

国家基因库由生物信息数据库和生物样本资源库组成,已经实现对基因信息数据总量达60PB的访问支持;制定基因信息数据采集、储存和管理相关标准和技术规范;1000万份可溯源性生物样本的存储能力,研究制定生物样本采集、储存和管理的相关标准和技术规范。

目前,世界上有3个公认的成型基因库,分别是美国的NCBI、日本的DDBJ、欧洲的EBI。这些基因库的主要功能是承载生物学研究产生出来的数据,特别是跟序列相关的核酸信息数据。

中国国家基因库与上面三个基因库有许多不同。。国家基因库创新性提出采用生物资源样本库(湿库)和生物信息数据库(干库)相结合的建设模式,收集全球生物物种和样本并进行储存,且把这些资源信息数字化,使之能够支撑科研和应用。

这一优势使得国家基因库成为既有数据、又有实体的新一代生物资源库、信息库、知识库和工具库,与传统的“干湿分离”的基因库相比,具有极强的竞争优势。

还有一点很重要的就是,国家基因库不仅注重“存”,也非常注重“用”。

国家基因库构建的生物样本和大数据存储、管理、认证、基础应用体系,正有序与国际权威数据库开展数据交换与共享,形成全球联盟体系,支撑引领生物大健康产业和生物经济快速发展。

目前,国家基因库与挪威世界末日种子库(据说9月22日有合作项目要发布!) 、国际生物和环境样本库协会(ISBER)、全球生物多样性联盟(GGBN)、人类基因变异组计划(HVP)、中国科学院海洋研究所、中国科学院昆明动物研究所、北京重大疾病临床数据和样本资源库、深圳超算中心等100多家国内外科研机构、行业组织建立了战略合作关系,在人类健康、生物多样性、生物进化机制等方面开展了合作研究。

最后,我们再来探讨这个问题:中国首个国家基因库为什么建在深圳?我国有那么多科研机构、大学、国有企业,为什么是华大基因研究院来组建和运营这样一个国家级平台?

国家基因库负责人、华大农业集团董事长梅永红曾在科技部政策法规与体制改革司司长、山东济宁市市长,对体制内外都有了解。他认为:

首先,华大基因是全球最大的测序机构,建国家基因库并不仅仅是收集和保存基因资源,更要使它得到应用,需要有数字化的过程,这恰恰是华大基因的优势。

其次,华大从1999年创立以来,拥有的基因数据是全球最大的,拥有的人类基因组数据一度占到全球的近50%,而且拥有超过70%的全球农业基因组数据。华大基因拥有的这些数据也是国家基因库特别是数据库中非常重要的资源。

第三,华大基因作为一个民办官助的新型研究机构,在利用国内外资源方面比体制内的机构具有更好的条件,能让资源得到充分共享。

梅永红说:“最初能决策把这样一个平台交给华大,应该是基于对中国现在这个领域发展的态势,以及我们过去在这种科研条件或者科研平台方面存在的问题而形成的决策。我认为这是非常开明的决策,也是非常有远见的决策。”

据介绍,国家基因库将以生物资源为依托,形成资源到科研到产业的全贯穿、全覆盖模式,实现大资源、大数据、大科学、大产业的整合与应用。应用方向包括人类健康、新型农业、物种多样性及生态环境保护等。

小编了解到,国家基因库是全世界最大的综合性基因库,1期建成后,综合能力世界第一,包括可访问数据量和数据存储能力是世界第一,可访问样本量和样本存储能力也是世界第一。(马芳 陈熊海 鲁力)

加载中...